Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMU1Q2TAY7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMU1Q2TAY7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMU1Q2TAY7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms