Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTC1Q2NKJ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms