Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDK4Q16654 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
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