Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMN1Q16637 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMN1Q16637 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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