Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAPC1Q16533 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAPC1Q16533 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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