Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZFHX3Q15911 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZFHX3Q15911 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZFHX3Q15911 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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