Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1EQ15878 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1EQ15878 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms