Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD1Q15797 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD1Q15797 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD1Q15797 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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