Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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TWIST1Q15672 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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