Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM1Q15629 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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