Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A2Q15428 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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