Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFRLQ15198 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms