Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KARSQ15046 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KARSQ15046 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KARSQ15046 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KARSQ15046 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KARSQ15046 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KARSQ15046 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KARSQ15046 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KARSQ15046 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KARSQ15046 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KARSQ15046 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KARSQ15046 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KARSQ15046 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KARSQ15046 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KARSQ15046 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KARSQ15046 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KARSQ15046 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KARSQ15046 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KARSQ15046 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KARSQ15046 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KARSQ15046 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KARSQ15046 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KARSQ15046 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KARSQ15046 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KARSQ15046 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KARSQ15046 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KARSQ15046 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KARSQ15046 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KARSQ15046 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KARSQ15046 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KARSQ15046 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KARSQ15046 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KARSQ15046 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KARSQ15046 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KARSQ15046 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KARSQ15046 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KARSQ15046 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KARSQ15046 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KARSQ15046 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KARSQ15046 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KARSQ15046 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KARSQ15046 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KARSQ15046 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KARSQ15046 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KARSQ15046 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KARSQ15046 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KARSQ15046 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KARSQ15046 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KARSQ15046 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KARSQ15046 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KARSQ15046 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KARSQ15046 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KARSQ15046 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KARSQ15046 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KARSQ15046 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KARSQ15046 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KARSQ15046 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KARSQ15046 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KARSQ15046 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KARSQ15046 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KARSQ15046 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KARSQ15046 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KARSQ15046 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KARSQ15046 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KARSQ15046 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KARSQ15046 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KARSQ15046 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KARSQ15046 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KARSQ15046 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KARSQ15046 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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