Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
UBE4AQ14139 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBE4AQ14139 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE4AQ14139 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE4AQ14139 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
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