Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms