Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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