Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LSAMPQ13449 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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