Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME3Q13232 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME3Q13232 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME3Q13232 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME3Q13232 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME3Q13232 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NME3Q13232 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME3Q13232 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME3Q13232 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME3Q13232 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME3Q13232 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME3Q13232 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME3Q13232 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME3Q13232 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME3Q13232 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME3Q13232 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME3Q13232 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME3Q13232 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME3Q13232 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME3Q13232 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME3Q13232 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME3Q13232 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME3Q13232 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME3Q13232 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME3Q13232 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME3Q13232 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME3Q13232 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NME3Q13232 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME3Q13232 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME3Q13232 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME3Q13232 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME3Q13232 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME3Q13232 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME3Q13232 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME3Q13232 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME3Q13232 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME3Q13232 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME3Q13232 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME3Q13232 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME3Q13232 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NME3Q13232 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME3Q13232 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME3Q13232 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME3Q13232 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME3Q13232 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME3Q13232 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NME3Q13232 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME3Q13232 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME3Q13232 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME3Q13232 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME3Q13232 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME3Q13232 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME3Q13232 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME3Q13232 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME3Q13232 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME3Q13232 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME3Q13232 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NME3Q13232 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NME3Q13232 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME3Q13232 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NME3Q13232 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NME3Q13232 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NME3Q13232 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NME3Q13232 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NME3Q13232 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME3Q13232 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME3Q13232 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME3Q13232 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME3Q13232 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME3Q13232 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME3Q13232 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME3Q13232 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME3Q13232 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME3Q13232 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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