Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA1Q13136 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIA1Q13136 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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