Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF2Q12933 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF2Q12933 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF2Q12933 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF2Q12933 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms