Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TROQ12816 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TROQ12816 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TROQ12816 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TROQ12816 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TROQ12816 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TROQ12816 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TROQ12816 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TROQ12816 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TROQ12816 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TROQ12816 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TROQ12816 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TROQ12816 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TROQ12816 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TROQ12816 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TROQ12816 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TROQ12816 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TROQ12816 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TROQ12816 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TROQ12816 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TROQ12816 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TROQ12816 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TROQ12816 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TROQ12816 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TROQ12816 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TROQ12816 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TROQ12816 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TROQ12816 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TROQ12816 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TROQ12816 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TROQ12816 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TROQ12816 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TROQ12816 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TROQ12816 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TROQ12816 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TROQ12816 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TROQ12816 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TROQ12816 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TROQ12816 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TROQ12816 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TROQ12816 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TROQ12816 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TROQ12816 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TROQ12816 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TROQ12816 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TROQ12816 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TROQ12816 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TROQ12816 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TROQ12816 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TROQ12816 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TROQ12816 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TROQ12816 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TROQ12816 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TROQ12816 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TROQ12816 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TROQ12816 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TROQ12816 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TROQ12816 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TROQ12816 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TROQ12816 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TROQ12816 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TROQ12816 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TROQ12816 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TROQ12816 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TROQ12816 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TROQ12816 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TROQ12816 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TROQ12816 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TROQ12816 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TROQ12816 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TROQ12816 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TROQ12816 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TROQ12816 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TROQ12816 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TROQ12816 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TROQ12816 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TROQ12816 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TROQ12816 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TROQ12816 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TROQ12816 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TROQ12816 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TROQ12816 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TROQ12816 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TROQ12816 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TROQ12816 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TROQ12816 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TROQ12816 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TROQ12816 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TROQ12816 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TROQ12816 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TROQ12816 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TROQ12816 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TROQ12816 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TROQ12816 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
TROQ12816 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TROQ12816 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TROQ12816 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TROQ12816 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TROQ12816 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TROQ12816 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
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