Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CPSF1Q10570 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CPSF1Q10570 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
CPSF1Q10570 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CPSF1Q10570 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
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