Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms