Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC15Q0P6D6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC15Q0P6D6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms