Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 UBX2YML013W 1755 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 URA7YBL039C 1740 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 SEC18YBR080C 2277 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 RRN3YKL125W 1884 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YLL017WYLL017W 312 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YGP1YNL160W 1065 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YOR200WYOR200W 399 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 ENV9YOR246C 993 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 MRPS5YBR251W 924 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YMR155WYMR155W 1644 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 YFL034WYFL034W 3222 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 FOB1YDR110W 1701 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK1Q07084 ACF2YLR144C 2340 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 PRS2YER099C 957 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 SKI8YGL213C 1194 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 YHR095WYHR095W 495 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 SEN34YAR008W 828 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 HCR1YLR192C 798 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 PPA2YMR267W 933 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 NOP13YNL175C 1212 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 RPS15YOL040C 429 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 ENV7YPL236C 1095 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 MRI1YPR118W 1236 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 CTF18YMR078C 2226 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 UGO1YDR470C 1509 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 TAX4YJL083W 1815 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 SSZ1YHR064C 1617 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 HFI1YPL254W 1467 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 RBA50YDR527W 1320 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 YDL144CYDL144C 1071 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 PCL9YDL179W 915 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 HST4YDR191W 1113 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 SUA5YGL169W 1281 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 NQM1YGR043C 1002 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 YKR041WYKR041W 753 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 YLR126CYLR126C 756 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 DHH1YDL160C 1521 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 VHS1YDR247W 1386 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 ABZ1YNR033W 2364 nt5□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 ASF2YDL197C 1578 nt5□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 BAP2YBR068C 1830 nt5□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 PHO86YJL117W 936 nt5□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 OSW5YMR148W 447 nt5□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 NRM1YNR009W 750 nt5□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 snR32snR32 188 nt5□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 DBF4YDR052C 2115 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 GLO2YDR272W 825 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 DFM1YDR411C 1026 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 YDR541CYDR541C 1035 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 SHP1YBL058W 1272 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 ARR1YPR199C 885 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 UTP18YJL069C 1785 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 LSM6YDR378C 261 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 CDC43YGL155W 1131 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 SPO7YAL009W 780 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 REX3YLR107W 1215 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 MRPL4YLR439W 960 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 YBL029WYBL029W 1131 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 SPG4YMR107W 348 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 NPT1YOR209C 1290 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 CSG2YBR036C 1233 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 COR1YBL045C 1374 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 MKC7YDR144C 1791 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 RPT4YOR259C 1314 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 QRI1YDL103C 1434 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 HXT3YDR345C 1704 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 YLH47YPR125W 1365 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 MED2YDL005C 1296 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 SPO74YGL170C 1242 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 RRP4YHR069C 1080 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 PRS1YKL181W 1284 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 PSR1YLL010C 1284 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 YBL044WYBL044W 369 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 POS5YPL188W 1245 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 ATG12YBR217W 561 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 BUD14YAR014C 2130 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 FOL1YNL256W 2475 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 SMF3YLR034C 1422 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 RPT2YDL007W 1314 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 PAF1YBR279W 1338 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 ACS2YLR153C 2052 nt4.96□□□□□ -1.61
SSK1Q07084 PHM8YER037W 966 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 ARP1YHR129C 1155 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YLR402WYLR402W 192 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 URE2YNL229C 1065 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 OAZ1YPL052W 879 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YPR109WYPR109W 885 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 GIP2YER054C 1647 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 HOS1YPR068C 1413 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 NRD1YNL251C 1728 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 TEF1YPR080W 1377 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 TEF2YBR118W 1377 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YDL114WYDL114W 927 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 IRC7YFR055W 1023 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 LAP2YNL045W 2016 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 NFI1YOR156C 2181 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 NSI1YDR026C 1713 nt4.94□□□□□ -1.62
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