Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms