Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABPB1Q06547 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms