Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PSME1Q06323 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSME1Q06323 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSME1Q06323 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms