Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNB3Q05901 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNB3Q05901 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms