Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF90Q03938 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF90Q03938 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms