Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC25A11Q02978 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A11Q02978 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms