Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF17Q02223 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms