Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHODHQ02127 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHODHQ02127 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHODHQ02127 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHODHQ02127 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHODHQ02127 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DHODHQ02127 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DHODHQ02127 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms