Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN7AQ01118 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCN7AQ01118 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms