Protein–RNA interactions for Protein: Q01085

TIAL1, Nucleolysin TIAR, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIAL1Q01085 HNRNPA1-211ENST00000551665 925 ntTSL 28.62□□□□□ -1.038e-7■■■■□ 24
TIAL1Q01085 HNRNPA1-214ENST00000551803 372 ntTSL 34.94□□□□□ -1.628e-7■■■■□ 24
TIAL1Q01085 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.088e-7■■■■□ 24
TIAL1Q01085 FKBP14-203ENST00000419018 1085 ntTSL 1 (best)4.66□□□□□ -1.668e-7■■■■□ 24
TIAL1Q01085 ACIN1-214ENST00000555352 579 ntTSL 49.14□□□□□ -0.952e-9■■■■□ 24
TIAL1Q01085 SLC5A6-213ENST00000461757 2307 ntTSL 218.32■□□□□ 0.523e-9■■■■□ 24
TIAL1Q01085 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.613e-9■■■■□ 24
TIAL1Q01085 SLC5A6-217ENST00000488743 3174 ntTSL 211.02□□□□□ -0.653e-9■■■■□ 24
TIAL1Q01085 SEC61A1-203ENST00000464451 1871 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 24
TIAL1Q01085 ACSL4-209ENST00000505075 390 ntTSL 35.04□□□□□ -1.65e-7■■■■□ 24
TIAL1Q01085 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-7■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-7■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 PAPOLA-205ENST00000553689 2267 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.952e-6■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-211ENST00000470908 884 ntTSL 512.47□□□□□ -0.415e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-209ENST00000463049 6102 ntTSL 58.6□□□□□ -1.035e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-212ENST00000471783 552 ntTSL 38.23□□□□□ -1.095e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.315e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.345e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.385e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.395e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.45e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.435e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.465e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.515e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.795e-8■■■■□ 23.9
TIAL1Q01085 ATF7IP2-209ENST00000562396 1681 nt22.28■■□□□ 1.162e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATF7IP2-216ENST00000569900 559 ntTSL 415.79■□□□□ 0.122e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATF7IP2-207ENST00000561932 538 ntTSL 414.37□□□□□ -0.112e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATF7IP2-210ENST00000562527 625 ntTSL 310.07□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATF7IP2-217ENST00000569939 564 ntTSL 47.33□□□□□ -1.242e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATF7IP2-211ENST00000564797 450 ntTSL 35.38□□□□□ -1.552e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATF7IP2-208ENST00000562102 558 ntTSL 44.38□□□□□ -1.712e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATF7IP2-218ENST00000570163 559 ntTSL 23.46□□□□□ -1.862e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATF7IP2-214ENST00000566316 576 ntTSL 23.11□□□□□ -1.912e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 319.28■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 216.41■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 215.67■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 NIT2-207ENST00000497785 795 ntTSL 524.85■■□□□ 1.579e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZNF12-202ENST00000394917 662 ntTSL 323.51■■□□□ 1.351e-12■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 GNPNAT1-205ENST00000557604 785 ntTSL 321.11■□□□□ 0.979e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.839e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.89e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.789e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.731e-12■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.639e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.579e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.579e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.549e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.529e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.67■□□□□ 0.429e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.319e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.39e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 TBCB-203ENST00000468156 630 ntTSL 216.7■□□□□ 0.269e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.211e-12■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 CNBP-210ENST00000512338 502 ntTSL 413.76□□□□□ -0.219e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 PRPF39-202ENST00000424478 3174 ntTSL 213.29□□□□□ -0.289e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.369e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 CNBP-209ENST00000507573 641 ntTSL 212.72□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.49e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 PRPF39-203ENST00000477626 3507 ntTSL 212.33□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 LIN54-206ENST00000506560 2757 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.459e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 HMGCR-208ENST00000509431 421 ntTSL 212.06□□□□□ -0.489e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 NIT2-203ENST00000465368 1469 ntTSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.489e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.59e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.569e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)11.12□□□□□ -0.639e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATAD2-202ENST00000517666 4995 ntTSL 511.02□□□□□ -0.649e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 LIN54-207ENST00000508171 2684 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.669e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.669e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 TBCB-207ENST00000586868 466 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.679e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 SRSF4-208ENST00000634348 8128 ntTSL 510.31□□□□□ -0.769e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.839e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.929e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.959e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZNF189-204ENST00000615466 2316 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.999e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.079e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.239e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.249e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 NIT2-205ENST00000478856 1655 ntTSL 26.28□□□□□ -1.49e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 PRPF39-209ENST00000556353 687 ntTSL 26.1□□□□□ -1.439e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.459e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)6.02□□□□□ -1.459e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.59e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 HMGCR-205ENST00000507942 527 ntTSL 45.49□□□□□ -1.539e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 PNN-206ENST00000557680 912 ntTSL 34.91□□□□□ -1.629e-7■■■■□ 23.8
TIAL1Q01085 NIT2-206ENST00000480073 625 ntTSL 34.77□□□□□ -1.659e-7■■■■□ 23.8
Retrieved 100 of 8,119 protein–RNA pairs in 114.2 ms