Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MDM2Q00987 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM2Q00987 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDM2Q00987 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms