Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCCQ00597 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FANCCQ00597 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms