Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COG7P83436 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG7P83436 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG7P83436 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG7P83436 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG7P83436 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COG7P83436 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG7P83436 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG7P83436 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG7P83436 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG7P83436 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG7P83436 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG7P83436 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COG7P83436 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG7P83436 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG7P83436 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG7P83436 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COG7P83436 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG7P83436 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG7P83436 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG7P83436 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG7P83436 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COG7P83436 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG7P83436 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG7P83436 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG7P83436 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG7P83436 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG7P83436 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG7P83436 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG7P83436 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG7P83436 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG7P83436 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG7P83436 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG7P83436 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG7P83436 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG7P83436 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG7P83436 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG7P83436 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COG7P83436 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COG7P83436 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG7P83436 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG7P83436 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG7P83436 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG7P83436 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG7P83436 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG7P83436 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG7P83436 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG7P83436 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COG7P83436 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG7P83436 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG7P83436 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG7P83436 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG7P83436 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG7P83436 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG7P83436 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG7P83436 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms