Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOMO3P69849 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOMO3P69849 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms