Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA4AP68366 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA4AP68366 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms