Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms