Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB5BP61020 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5BP61020 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5BP61020 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms