Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTBP60709 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTBP60709 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTBP60709 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTBP60709 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTBP60709 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTBP60709 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTBP60709 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTBP60709 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTBP60709 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTBP60709 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTBP60709 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTBP60709 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTBP60709 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTBP60709 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTBP60709 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTBP60709 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACTBP60709 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACTBP60709 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACTBP60709 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACTBP60709 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACTBP60709 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACTBP60709 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms