Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXL3P58215 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms