Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EEFSECP57772 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEFSECP57772 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms