Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3AP57075 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms