Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX8P57073 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX8P57073 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX8P57073 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX8P57073 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX8P57073 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX8P57073 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX8P57073 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX8P57073 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX8P57073 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX8P57073 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX8P57073 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX8P57073 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX8P57073 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX8P57073 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX8P57073 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX8P57073 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX8P57073 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX8P57073 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX8P57073 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX8P57073 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX8P57073 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX8P57073 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX8P57073 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX8P57073 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX8P57073 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX8P57073 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX8P57073 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX8P57073 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX8P57073 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX8P57073 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX8P57073 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX8P57073 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX8P57073 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX8P57073 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX8P57073 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX8P57073 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX8P57073 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX8P57073 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX8P57073 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX8P57073 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX8P57073 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX8P57073 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX8P57073 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms