Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL23P55773 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL23P55773 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL23P55773 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL23P55773 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL23P55773 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL23P55773 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL23P55773 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL23P55773 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL23P55773 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL23P55773 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL23P55773 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL23P55773 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL23P55773 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL23P55773 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL23P55773 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL23P55773 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL23P55773 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL23P55773 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL23P55773 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL23P55773 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL23P55773 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL23P55773 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL23P55773 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL23P55773 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL23P55773 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL23P55773 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL23P55773 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL23P55773 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL23P55773 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL23P55773 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCL23P55773 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCL23P55773 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCL23P55773 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCL23P55773 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCL23P55773 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCL23P55773 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCL23P55773 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCL23P55773 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCL23P55773 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCL23P55773 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCL23P55773 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCL23P55773 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCL23P55773 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCL23P55773 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCL23P55773 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCL23P55773 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCL23P55773 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL23P55773 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL23P55773 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL23P55773 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL23P55773 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL23P55773 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL23P55773 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL23P55773 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL23P55773 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL23P55773 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL23P55773 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL23P55773 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCL23P55773 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCL23P55773 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCL23P55773 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCL23P55773 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL23P55773 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCL23P55773 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCL23P55773 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms