Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELLP55199 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ELLP55199 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
ELLP55199 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ELLP55199 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELLP55199 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELLP55199 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELLP55199 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELLP55199 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELLP55199 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELLP55199 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELLP55199 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELLP55199 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELLP55199 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELLP55199 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ELLP55199 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ELLP55199 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ELLP55199 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ELLP55199 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ELLP55199 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELLP55199 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELLP55199 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELLP55199 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELLP55199 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELLP55199 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELLP55199 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELLP55199 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELLP55199 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELLP55199 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms