Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHBP55084 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHBP55084 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHBP55084 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHBP55084 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHBP55084 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHBP55084 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHBP55084 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHBP55084 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHBP55084 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHBP55084 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHBP55084 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHBP55084 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHBP55084 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHBP55084 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHBP55084 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHBP55084 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHBP55084 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHBP55084 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HADHBP55084 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HADHBP55084 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HADHBP55084 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HADHBP55084 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HADHBP55084 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HADHBP55084 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HADHBP55084 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HADHBP55084 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HADHBP55084 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HADHBP55084 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HADHBP55084 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HADHBP55084 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms